Казанский А.Б. Расширенное понимание механизмов наследования и естественного отбора: конструирование экологических ниш и стигмергия // Сб. тезисов международной научной конференции “Чарльз Дарвин и современная биология” – СПб, 23-25 сентября 2009 г. — СПб Научный Центр РАН, 2009, с.53-55.
Левченко В.Ф., Меншуткин В.В. Попытка компьютерного моделирования эволюции человеческого общества // Журн. эвол. биохим. и физиол., 45(2), 2009. С. 251–261.
Меншуткин В.В. (2009): Объектно-ориентированная модель человеческой популяции с учетом экономических факторов // Экономико-математические исследования. Математические модели и информационные технологии. Т.VIII. СПб: 314-327.
Меншуткин В.В., Филатов Н.Н. Потахин М.С. (2009): Экспертная система «Озера Карелии»:1.Ординальные и номинальные характеристики озер // Водные ресурсы. том.36. №2: 160-171.
Меншуткин В.В., Филатов Н.Н., Потахин М.С. (2009): Экспертная система «Озера Карелии». 2. Классификация озер // Водные ресурсы. том.36. №3: 300-311.
Manu M., Surkova S., Spirov A.V., Gursky V.V., Janssens H., Kim A.R., Radulescu O., Vanario-Alonso C.E., Sharp D.H., Samsonova M., Reinitz J. Canalization of Gene Expression in the Drosophila Blastoderm by Gap Gene Cross Regulation PLoS Biol., 7(3), 2009. pdf
Manu M., Surkova S, Spirov AV, Gursky VV, Janssens H, Kim AR, Radulescu O, Vanario-Alonso CE, Sharp DH, Samsonova M, Reinitz J. Canalization of Gene Expression and Domain Shifts in the Drosophila Blastoderm by Dynamical Attractors. PLoS Comput. Biol., 5(3), 2009. pdf
Spirov A.V., Fahmy K, Schneider M, Frei E, Noll M, Baumgartner S. Formation of the bicoid morphogen gradient: an mRNA gradient dictates the protein gradient. Development. 2009, 136(4). pdf